三方协议只盖章不一定有效，需满足真实合法等要件。《合同法》规定，协议需双方真实意思表示，主体适格，不违反法律。若约定或法定需盖章生效，则未盖章无效，可能导致协议无法履行，产生纠纷。
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三方协议处理方式多样，可协商、可诉讼。应先尝试友好协商，明确各方权责；协商不成时，可依据协议内容向法院提起诉讼，以法律手段维护权益。
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三方协议只盖章不够。处理如下：1. 检查协议内容，确保真实合法，主体适格；2. 若协议未明确盖章要求，但双方认可，可补充签字确认；3. 若协议约定或法律规定必须盖章，需及时补盖；4. 如遇纠纷，先协商，协商不成可诉讼。